姓名：陈挺

职称：教授

电话：010-62787101

邮箱：tingchen@tsinghua.edu.cn

URL：http://timlab.cn/

教育背景

工学学士 (计算机科学)， 清华大学，中国，1993;

哲学博士 (计算机科学)，纽约州立大学石溪分校，美国，1997;

工作履历

讲师 (遗传学)，哈佛大学医学院， 美国, 1997-2000；

教授（生命科学，计算机科学，数学），南加州大学，美国，2000-2013；

千人计划教授（计算机科学），清华大学，中国 2013-

学术兼职

清华大学数科院  健康医疗大数据中心：主任 (2016-);

研究领域

生物信息，医学信息，计算机算法，机器学习

研究概况

陈挺教授2013年入选国家第九批千人计划，现为清华大学数据科学研究院，医疗和健康大数据研究中心主任。任职于清华大学信息科学与技术国家实验室、生物信息研究部，www.288sb.com、智能技术与系统国家重点实验室。1988年保送进入清华大学计算机系学习，1993年获学士学位，1997年获美国纽约州立大学石溪分校计算机科学博士学位。1997至2000年，任美国哈佛大学遗传学讲师；2000至2013年，历任美国南加州大学（University of Southern California）生命科学系，计算机科学系，数学系助理教授、副教授、正教授，曾经担任南加州大学计算生物学部主任（相当于系主任）。

陈挺教授长期研究大数据高效算法设计和机器学习，并应用于研究人类基因组、转录组和蛋白组的高通量大数据分析和功能预测。在生物调控系统的数学模型、蛋白质组学以及质谱仪数据处理、高通量基因组测序数据处理、宏基因组数据处理，复杂疾病的遗传学研究，医学信息处理等方面均取得了一系列重要的研究成果。负责及参与美国自然科学基金会（NSF）、美国国家卫生研究院（NIH），中国自然科学基金（NSFC）等项目十余项。在Science、PNAS、Genome Research、American Journal of Human Genetics, Cell Systems, GenomeBiology等国际著名期刊发表学术论文90余篇，被引超过10000次（Google Scholar），其中19篇论文被引用超过100次。2004年获得美国史隆基金会研究奖（Sloan Fellow）。

奖励与荣誉

2004年获得美国史隆基金会研究奖（Sloan Fellow）

学术成果

1.Yang Y, Chen N*, Chen T* (2017). mLDM: a new hierarchical Bayesian statistical model for sparse microbial association discovery. RECOMB 2016.Cell Systems. Volume 4, Issue 1, p129–137.e5, 25 January 2017.

2.Jiang L, Chen N* and Chen T* (2016) DACE: A Scalable DP-means algorithm for clustering extremely large sequence data. Bioinformatics. doi:10.1093/bioinformatics/btw722.

3.Zeng F, Jiang R* and Chen T* (2013)  PyroHMMSNP: a SNP caller for Ion Torrent and 454 Sequencing Data. Nucleic Acid Research. 1-13, doi:10.1093/nar/gkt372.

4.Lehmann K and Chen T* (2012)  Exploring functional variant discovery in non-coding regions with SInBaD. Nucleic Acid Research,August 31, 2012 doi:10.1093/nar/gks800.

5.Hao X, Jiang R, and Chen T* (2011) Clustering 16S rRNA for OTU prediction: a method of unsupervised Bayesian clustering. Bioinformatics. 2011 Mar 1;27(5):611-8. Epub 2011 Jan 13.

6.Chen Y, Souaiaia T, and Chen T* (2009) PerM: Efficient Mapping of Short Sequencing Reads with Periodic Full Sensitive Spaced Seeds. Bioinformatics. 25(19):2514-21.

7.Wang L, Sun F and Chen T*. (2008) Prioritizing functional modules mediating genetic perturbations and their phenotypic effects: a global strategy. Genome Biology. 9:R174, 2008.

8.Dutta D. and Chen T*. (2007) Speeding up Tandem Mass Spectrometry Database Search: Metric Embeddings and Fast Near Neighbor Search. Bioinformatics 2007; Mar 1;23(5):612-8.

9.Jiang R, Yang H, Kuo J CC, Sun F and Chen T*. (2007) Sequence-based prioritization of nonsynonymous single nucleotide polymorphisms for the study of disease mutations. American Journal of Human Genetics. 2007 Aug;81(2):346-60.

10.Jiang R, Tu Z, Chen T* and Sun F*. (2006) Network Motif Identification in Stochastic Networks. The Proceedingof National Academy of Sciences (PNAS). 2006. vol 103 no 2 page 9404-9. (* corresponding authors)